主要有以下区别：
1、“舍本逐末”多指处理事情，“本末倒置”多指评论事理；
2、“舍本逐末”作定语时，一般都用办法、方法、措施、做法等为中心词 。“本末倒置”作定语时，一般都用说法、结论、提法等作中心词；
3、“舍本逐末”作谓语时，主语多指一事件，一种做法 。“本末倒置”作谓语时，主语多指一种理论，一种说法；
【舍本逐末和本末倒置的区别】4、"本末倒置"是指把主次的位置颠倒，"舍本逐末"指丢掉主要的，追求次要的 。

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